Mis vahe on 16s rRNA ja 18s RRNA vahel?
Mis vahe on 16s rRNA ja 18s RRNA vahel?

Video: Mis vahe on 16s rRNA ja 18s RRNA vahel?

Video: Mis vahe on 16s rRNA ja 18s RRNA vahel?
Video: DNA vs RNA (Updated) 2024, November
Anonim

Peamine vahe vahel analüüside tegemine koos 18S rRNA asemel geeniandmed 16S rRNA geeniandmed (või ITS-andmed) on võrdlusandmebaas, mida kasutatakse OTU valimiseks, taksonoomilisteks määramisteks ja mallipõhiseks joondamise ehitamiseks, kuna see peab sisaldama eukarüootseid järjestusi.

Seda arvestades, miks kasutatakse identifitseerimiseks 16s rRNA geeni?

The 16S ribosomaalne RNA geen kodeerib bakteriaalse ribosoomi 30S subühiku RNA komponenti. DNA-DNA hübridisatsiooni keerukuse tõttu 16S rRNA geen järjestus on kasutatud vahendina selleks tuvastada bakterid liigi tasandil ja aitavad eristada lähedalt seotud bakteriliike [8].

Lisaks, kas eukarüootidel on 16s rRNA? The 16S rRNA geen esineb kõigis bakterites ja sarnane vorm esineb kõigis rakkudes, sealhulgas nendes eukarüootid.

Samuti on küsimus, mis on 18s ja 28s rRNA?

The 28S / 18S ribosomaalne RNA suhet kasutatakse sageli mis tahes proovist puhastatud kogu-RNA kvaliteedi hindamiseks. Inimestel 28S rRNA on ~ 5070 nukleotiidi ja 18S on 1869 nukleotiidi, mis annab a 28S / 18S suhe ~2,7. Kõrge 28S / 18S suhe näitab, et puhastatud RNA on puutumatu ja ei ole lagunenud.

Mis on 16s rRNA sekveneerimine?

16S rRNA geen järjestus analüüs on standardne meetod bakterite taksonoomias ja identifitseerimises ning põhineb bakterite tuvastamisel järjestus erinevused (polümorfismid) hüpervarieeruvates piirkondades 16S rRNA geen, mis esineb kõigis bakterites.

Soovitan: