Mis on 16s rRNA funktsioon?
Mis on 16s rRNA funktsioon?

Video: Mis on 16s rRNA funktsioon?

Video: Mis on 16s rRNA funktsioon?
Video: Sequencing and the American Gut Project | Illumina MiSeq, 16S rRNA 2024, November
Anonim

Pikkus 16S rRNA kodeeriv geen on umbes 1500 bp, mis sisaldab umbes 50 funktsionaalset domeeni. 16S rRNA on mitmeid funktsioonid : ?Ribosomaalsete valkude immobiliseerimine toimib karkassina. a3'-ots sisaldab pöörd-SD järjestust, mida kasutatakse mRNA AUG initsiatsioonikoodoniga seondumiseks.

Mis on 16s rRNA esmane funktsioon?

16S ribosomaalne RNA (või 16S rRNA ) on prokarüootse ribosoomi väikese subühiku 30S komponent, mis seondub Shine-Dalgarno järjestusega. Seda kodeerivaid geene nimetatakse 16S rRNA geeni ja neid kasutatakse fülogeneeside rekonstrueerimiseks geeni selle piirkonna aeglase evolutsiooni tõttu.

Samuti, mis on 16s rRNA geenide sekveneerimine? 16S rRNA geenijärjestus analüüs on standardne meetod bakterite taksonoomias ja identifitseerimises ning põhineb bakterite tuvastamisel järjestus erinevused (polümorfismid) hüpervarieeruvates piirkondades 16S rRNA geen mida leidub kõigis bakterites.

Lisaks ülaltoodule, miks kasutatakse bakterite tuvastamiseks 16s rRNA-d?

The 16S ribosomaalne RNA geen kodeerib 30S alaühiku RNA komponenti bakteriaalne ribosoom. DNA-DNA hübridisatsiooni keerukuse tõttu 16S rRNA geenide järjestamine on kasutatud vahendina selleks tuvastada bakterid liigi tasandil ja aitavad teha vahet lähedastel sugulastel bakteriaalne liigid [8].

Mis vahe on 16s rRNA ja 18s RRNA vahel?

Peamine vahe vahel analüüside tegemine koos 18S rRNA asemel geeniandmed 16S rRNA geeniandmed (või ITS-andmed) on võrdlusandmebaas, mida kasutatakse OTU valimiseks, taksonoomilisteks määramisteks ja mallipõhiseks joondamise ehitamiseks, kuna see peab sisaldama eukarüootseid järjestusi.

Soovitan: