Video: Kuidas kontiigid tellinguteks kokku pannakse?
2024 Autor: Miles Stephen | [email protected]. Viimati modifitseeritud: 2023-12-15 23:35
Genoomi mustandi loomisel on kõigepealt DNA individuaalsed lugemised koondatud kontiigideks , mis oma olemuselt kokkupanek , nende vahel on lünki. Järgmine samm on juurde seejärel sillutage nende vahelised lüngad jätkub Loo tellingud . Seda saab teha kas optilise kaardistamise või mate-pair järjestuse abil.
Samamoodi võite küsida, mis on kontiigid ja tellingud?
A tellingud on genoomi järjestuse osa, mis on rekonstrueeritud lõppjärjestusega kogu genoomi haavli kloonidest. Tellingud koosnevad kontiigid ja lüngad. A contig on genoomse järjestuse külgnev pikkus, milles aluste järjekord on teada suure usaldusnivooga. Mõningatel juhtudel, tellingud võivad kattuda.
Samuti, mis on kontiigid bioinformaatikas? A contig (külgnevast) on kattuvate DNA segmentide kogum, mis koos esindavad DNA konsensuspiirkonda. Kontiigid Seega võib see olenevalt kontekstist viidata nii kattuvale DNA järjestusele kui ka kattuvatele füüsilistele segmentidele (fragmentidele), mis sisalduvad kloonides.
Kuidas sellega seoses kontiigid kokku pannakse?
DNA fragmentide kattuva DNA järjestuse komplekt on tuntud kui a contig . Contig kaardistamine on protsess, mille käigus tehakse kattuvad kloonid kokku pandud et kattuda. See hõlmab korraldamist kontiigid järjekorras ja orientatsioonis. Klooni kontiigid saab automaatselt kokku pandud kasutades nende BAC-otsa järjestusi.
Miks on kontiigid olulised?
Contig kokkupanek on an oluline genoomi kokkupanemise etapp. Kaardistamise jaoks koondatakse kattuvad kloonid kattuvate järjestuste järgi. Iga fragment kloonitakse vektorisse ja sekveneeritakse mõlemast otsast, et saada järjestuse pikkus ligikaudu 600–700 aluspaari. DNA fragmendi mõlemast otsast pärinevat järjestust nimetatakse paarisotsaks.
Soovitan:
Kuidas sa oma keelt kokku paned?
Sammud Suruge keel vastu suu alaosa. Võite seda nimetada ka suupõhjaks. Tasandage oma keel nii, et see kataks suu põhja. Keerake iseseisvalt keele servad kokku. Keerake keele servad kokku. Lükake keel välja, hoides samal ajal selle kuju
Kuidas vektoreid kokku liita?
Kahe vektori liitmiseks või lahutamiseks liidetakse või lahutatakse vastavad komponendid. Olgu →u=?u1,u2? ja→v=?v1,v2? olema kaks vektorit. Kahe või enama vektori summat nimetatakse resultandiks. Kahe vektori resultandi saab leida kas rööpkülikumeetodi või kolmnurga meetodi abil
Kuidas rakud kokku puutuvad, moodustades kudesid?
Mitmerakulistes organismides ühinevad rakud, moodustades erinevat tüüpi kudesid. Need koed moodustavad taimede struktuuride ja loomaorganite ehitusplokid. Rakud seostuvad üksteisega, moodustades spetsiaalseid valke kasutades kudesid
Kuidas DNA välja nägi, seostas selle keemilist struktuuri sellega, kuidas see välja näeb, kui palju seda on kokku klombitud?
Seostage selle keemiline struktuur sellega, kuidas see välja näeb, kui palju seda on kokku klombitud. DNA nägi välja nagu ämblikuvõrk. DNA oli DNA ekstraheerimispuhvris lahustuv, nii et me ei näinud seda. Kui see segati etanooliga, kleepus see kokku ja moodustas jämedamad ja paksemad kiud, mis olid piisavalt suured, et näha
Kuidas tõestada, et kaks rida langevad kokku?
Kui rida on kirjutatud kujul Ax + By = C, on nende lõikepunkt võrdne C/B-ga. Kui süsteemi igal sirgel on sama kalle, kuid erinev y-lõik, on sirged paralleelsed ja lahendust pole. Kui süsteemi igal real on sama kalle ja sama y-lõikepunkt, langevad jooned kokku